Forskare med inriktning mot metabolomik - Lediga jobb

Gnothis AB is seeking for a hands-on engineer who enjoys building experimental systems in a laboratory environment. The role combines microfluidics integration, instrument prototyping, and Python-based automation. This is a permanent position based at our HQ, located at the campus of Stockholm University (Stockholm, Sweden).

Gnothis, founded in 2015 and supported by highly innovative industrial professionals and technology developers, is on a mission to develop a new frontier for single molecule DNA sequencing; to break the mold on how sequencing is used as a clinical tool for the diagnosis of complex diseases. Gnothis technology integrates a wide range of cutting-edge sciences ranging from nanotechnology, photophysics, optics, surface chemistry, biochemistry and computational science.

Since we have taken significant steps forward and now need to solve the remaining crucial challenges before commercialization; for the right person this is a unique opportunity to become a valuable member, to use your “think-outside-the box” mentality with aim to develop a new world-class technology platform!

Our instrumentation, software and analysis team currently consists of four engineers and we are now expanding the team as we scale development of the system. The work is primarily on-site and very practical, involving both hardware integration and control software development.

The position is part of a multidisciplinary team developing a prototype DNA sequencing instrument combining microscopy, microfluidics, nanofabrication and advanced data analysis.

Initial Project

The first major task will be to design and integrate a microfluidics subsystem into our existing microscope prototype – to plan, test, order and add already commercially available components to a final prototype.

This includes selecting and integrating a commercial microfluidics system (e.g. Elveflow or similar), designing a custom sample chip holder and fluid interface, integrating control into an existing Python control software, and establishing practical operation and cleaning procedures.

The work is supported by a biochemistry team, but we are seeking for the right candidate who can make confident engineering decisions based on previous hands-on experiences connected to eg. microfluidics and laboratory automation.

Responsibilities

• Mechanically integrate new devices into a prototype life-science instrument. The initial focus is on liquid sample handling, such as flow and temperature control.

• Develop Python control and automation software, starting from existing vendor SDKs.

• Design simple mechanical parts (CAD / 3D printing)

• Hands-on prototyping and debugging in the lab

• Method development for instrument performance evaluation and self-calibration.

Over time the role will involve increasing focus on automation and device control software.

Candidate Profile

For you to enjoy performing expected activities, and being a valuable member in an ambitious and innovative team; we think you are an engineer with a strong creative mindset and with strong previous experience building/developing scientific or laboratory instrumentation.

This role suits someone who enjoys experimental prototyping in a small startup environment. The candidate should be comfortable collaborating in a multidisciplinary research environment consisting of engineering, software, biochemistry and nanofabrication experts.

Relevant backgrounds and skills include:

• Master of Science and/or Ph.D. educational background – ideally combined with a relevant Life Science focus.

• Practical experience with microfluidics systems

• Python programming for hardware control

• Comfortable with hands-on lab engineering (CAD, electronics, prototyping)

• Microscopy / Optics / Imaging

• Lab automation / Liquid handling

• Mechatronics / Robotics

A recent Ph.D. with strong hands-on instrument development experience could also be a good fit for this position.

Gnothis offer a creative environment focused on technology and product development, a competitive compensation package and plenty of room for self-development as the company expands. This is a permanent position (not consultant assignment).

If above sounds like an exciting opportunity and you would like to hear more, do not hesitate and submit your application and we will get back to you!

Gnothis AB on LinkedIn: https://www.linkedin.com/company/gnothis/posts/?feedView=all

For inquires please email us at: markus.dahl@valleyrecruitment.se

Gnothis AB is seeking for a hands-on engineer who enjoys building experimental systems in a laboratory environment. The role combines microfluidics integration, instrument prototyping, and Python-based automation. This is a permanent position based at our HQ, located at the campus of Stockholm University (Stockholm, Sweden).

Gnothis, founded in 2015 and supported by highly innovative industrial professionals and technology developers, is on a mission to develop a new frontier for single molecule DNA sequencing; to break the mold on how sequencing is used as a clinical tool for the diagnosis of complex diseases. Gnothis technology integrates a wide range of cutting-edge sciences ranging from nanotechnology, photophysics, optics, surface chemistry, biochemistry and computational science.

Since we have taken significant steps forward and now need to solve the remaining crucial challenges before commercialization; for the right person this is a unique opportunity to become a valuable member, to use your “think-outside-the box” mentality with aim to develop a new world-class technology platform!

Our instrumentation, software and analysis team currently consists of four engineers and we are now expanding the team as we scale development of the system. The work is primarily on-site and very practical, involving both hardware integration and control software development.

The position is part of a multidisciplinary team developing a prototype DNA sequencing instrument combining microscopy, microfluidics, nanofabrication and advanced data analysis.

Initial Project

The first major task will be to design and integrate a microfluidics subsystem into our existing microscope prototype – to plan, test, order and add already commercially available components to a final prototype.

This includes selecting and integrating a commercial microfluidics system (e.g. Elveflow or similar), designing a custom sample chip holder and fluid interface, integrating control into an existing Python control software, and establishing practical operation and cleaning procedures.

The work is supported by a biochemistry team, but we are seeking for the right candidate who can make confident engineering decisions based on previous hands-on experiences connected to eg. microfluidics and laboratory automation.

Responsibilities

• Mechanically integrate new devices into a prototype life-science instrument. The initial focus is on liquid sample handling, such as flow and temperature control.

• Develop Python control and automation software, starting from existing vendor SDKs.

• Design simple mechanical parts (CAD / 3D printing)

• Hands-on prototyping and debugging in the lab

• Method development for instrument performance evaluation and self-calibration.

Over time the role will involve increasing focus on automation and device control software.

Candidate Profile

For you to enjoy performing expected activities, and being a valuable member in an ambitious and innovative team; we think you are an engineer with a strong creative mindset and with strong previous experience building/developing scientific or laboratory instrumentation.

This role suits someone who enjoys experimental prototyping in a small startup environment. The candidate should be comfortable collaborating in a multidisciplinary research environment consisting of engineering, software, biochemistry and nanofabrication experts.

Relevant backgrounds and skills include:

• Master of Science and/or Ph.D. educational background – ideally combined with a relevant Life Science focus.

• Practical experience with microfluidics systems

• Python programming for hardware control

• Comfortable with hands-on lab engineering (CAD, electronics, prototyping)

• Microscopy / Optics / Imaging

• Lab automation / Liquid handling

• Mechatronics / Robotics

A recent Ph.D. with strong hands-on instrument development experience could also be a good fit for this position.

Gnothis offer a creative environment focused on technology and product development, a competitive compensation package and plenty of room for self-development as the company expands. This is a permanent position (not consultant assignment).

If above sounds like an exciting opportunity and you would like to hear more, do not hesitate and submit your application and we will get back to you!

Gnothis AB on LinkedIn: https://www.linkedin.com/company/gnothis/posts/?feedView=all

For inquires please email us at: markus.dahl@valleyrecruitment.se

Gnothis AB is seeking for a skilled Software Engineer who enjoys building experimental systems in a laboratory environment. This is a permanent position based at our HQ, located at the campus of Stockholm University (Stockholm, Sweden).

Gnothis, founded in 2015 and supported by highly innovative industrial professionals and technology developers, is on a mission to develop a new frontier for single molecule DNA sequencing; to break the mold on how sequencing is used as a clinical tool for the diagnosis of complex diseases. Gnothis technology integrates a wide range of cutting-edge sciences ranging from nanotechnology, photophysics, optics, surface chemistry, biochemistry and computational science.

Our instrumentation, software and analysis team currently consists of four engineers and we are now expanding the team as we scale development of the system.

We are seeking for an engineer with strong data analysis and scientific programming experience to develop our DNA sequencing data analysis pipeline. The role combines algorithm development, image analysis, and scientific data exploration, working closely with our instrumentation and biochemistry teams.

The work involves analyzing experimental data from our microscopy-based sequencing platform and developing the automated analysis pipeline that converts raw microscopy data into DNA sequencing results.

The position is part of a multidisciplinary team developing a prototype DNA sequencing instrument combining microscopy, microfluidics, nanofabrication and advanced data analysis.

Initial Project

The initial assignment will be to continuously analyze the latest experimental data from the lab in close collaboration with the biochemistry and instrument teams. This means developing new analysis algorithms, critically reviewing results together with the team, and driving experiment design to better address the research questions.

The work includes analyzing fluorescence microscopy data, developing algorithms for tasks such as peak detection and classification, and translating manual analysis workflows into automated pipelines using Python and Airflow. We are seeking for the right candidate who can make confident decisions based on previous experiences connected to laboratory environments (eg. development of diagnostic software tools and/or processing of fluorescence microscopy raw data).

Responsibilities

• Develop algorithms and analysis methods for microscopy-based sequencing data

• Implement automated analysis pipelines in Python and Airflow

• Perform exploratory analysis of experimental datasets and extract meaningful insights

• Collaborate closely with instrumentation and biochemistry teams to interpret results and improve experiments

• Develop tools for data visualization, evaluation and reporting

• Contribute to building a robust and scalable DNA sequencing analysis workflow.

Candidate Profile

For you to enjoy performing expected activities, and being a valuable member in an ambitious and innovative team; we think you are an engineer or scientist with strong experience in scientific programming and data analysis.

This role suits someone who enjoys working deeply with experimental datasets and extracting insight through algorithm development, statistical analysis and careful data interpretation.

The candidate should be comfortable working independently with complex datasets and driving the development of analysis methods in collaboration with a small multidisciplinary team.

Relevant backgrounds and skills include:

• Master of Science and/or Ph.D educational background – ideally combined with a relevant Life Science focus.

• Python programming for scientific computing

• Image analysis and signal processing

• Microscopy or fluorescence imaging data

• Statistics and experimental data analysis

• Scientific visualization and reporting

• DNA sequencing or genomics data

A PhD with strong experience in microscopy data, sequencing data, or similar experimental datasets is highly preferred.

Gnothis offer a creative environment focused on technology and product development, a competitive compensation package and plenty of room for self-development as the company expands. This is a permanent position (not consultant assignment).

If above sounds like an exciting opportunity and you would like to hear more, do not hesitate and submit your application and we will get back to you!

Gnothis AB on LinkedIn: https://www.linkedin.com/company/gnothis/posts/?feedView=all

For inquires please email us at: markus.dahl@valleyrecruitment.se

Vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi vid Sahlgrenska akademin bedrivs omfattande forskning och undervisning över stora kunskapsområden - från molekyl till människa. Verksamheten utgörs av fem sektioner; farmakologi, fysiologi, hälsa och rehabilitering, klinisk neurovetenskap samt psykiatri och neurokemi.

Institutionen för neurovetenskap och fysiologi söker nu en forskare med placering vid Sektionen för farmakologi.

Arbetsuppgifter

I anställningen ingår djurexperimentell forskning inom det psykofarmakologiska området, med tonvikt på beteendefarmakologiska studier.

Kvalifikationer

Doktorsavhandling inom preklinisk psykofarmakologi med inriktning på beteendestudier är ett krav. Erfarenhet av forskning om läkemedel mot depression och ångest med användning av relevanta djurmodeller är meriterande. Erfarenhet av in vivo-mikrodialys är också meriterande.

Vi lägger stor vikt vid personlig lämplighet.

Anställning

Anställningen är en tidsbegränsad anställning i 6 månader, 100% av heltid, med placering tills vidare vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi. Tillträde: snarast eller enligt överenskommelse. 

Kontaktuppgifter för anställningen

Har du frågor om anställningen är du välkommen att kontakta forskare Elias Eriksson, tfn: +46 709 555 055, e-post: mailto:Elias.Eriksson@neuro.gu.se

Ansvarig chef är professor/sektionschef Michael Winder, tfn: +46 31 786 34 77, e-post: mailto:michael.winder@pharm.gu.se

Ansökningshandlingar skickas inte till kontaktpersonerna.

Fackliga organisationer

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande

Ansökan

Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att registrera din ansökan elektroniskt via hemsidan: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar

Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Intyg om doktorsexamen bifogas med ansökan.

Ansökan ska vara inkommen senast: 2026-07-29

Vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi vid Sahlgrenska akademin bedrivs omfattande forskning och undervisning över stora kunskapsområden - från molekyl till människa. Verksamheten utgörs av fem sektioner; farmakologi, fysiologi, hälsa och rehabilitering, klinisk neurovetenskap samt psykiatri och neurokemi.

Institutionen för neurovetenskap och fysiologi söker nu en forskare med placering vid Sektionen för farmakologi.

Arbetsuppgifter

I anställningen ingår djurexperimentell forskning inom det psykofarmakologiska området, med tonvikt på beteendefarmakologiska studier.

Kvalifikationer

Doktorsavhandling inom preklinisk psykofarmakologi med inriktning på beteendestudier är ett krav. Erfarenhet av forskning om läkemedel mot depression och ångest med användning av relevanta djurmodeller är meriterande. Erfarenhet av in vivo-mikrodialys är också meriterande.

Vi lägger stor vikt vid personlig lämplighet.

Anställning

Anställningen är en tidsbegränsad anställning i 6 månader, 100% av heltid, med placering tills vidare vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi. Tillträde: snarast eller enligt överenskommelse. 

Kontaktuppgifter för anställningen

Har du frågor om anställningen är du välkommen att kontakta forskare Elias Eriksson, tfn: +46 709 555 055, e-post: mailto:Elias.Eriksson@neuro.gu.se

Ansvarig chef är professor/sektionschef Michael Winder, tfn: +46 31 786 34 77, e-post: mailto:michael.winder@pharm.gu.se

Ansökningshandlingar skickas inte till kontaktpersonerna.

Fackliga organisationer

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande

Ansökan

Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att registrera din ansökan elektroniskt via hemsidan: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar

Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Intyg om doktorsexamen bifogas med ansökan.

Ansökan ska vara inkommen senast: 2026-07-29

Vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi vid Sahlgrenska akademin bedrivs omfattande forskning och undervisning över stora kunskapsområden - från molekyl till människa. Verksamheten utgörs av fem sektioner; farmakologi, fysiologi, hälsa och rehabilitering, klinisk neurovetenskap samt psykiatri och neurokemi.

Institutionen för neurovetenskap och fysiologi söker nu en forskare med placering vid Sektionen för farmakologi.

Arbetsuppgifter

I anställningen ingår djurexperimentell forskning inom det psykofarmakologiska området, med tonvikt på beteendefarmakologiska studier.

Kvalifikationer

Doktorsavhandling inom preklinisk psykofarmakologi med inriktning på beteendestudier är ett krav. Erfarenhet av forskning om läkemedel mot depression och ångest med användning av relevanta djurmodeller är meriterande. Erfarenhet av in vivo-mikrodialys är också meriterande.

Vi lägger stor vikt vid personlig lämplighet.

Anställning

Anställningen är en tidsbegränsad anställning i 6 månader, 100% av heltid, med placering tills vidare vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi. Tillträde: snarast eller enligt överenskommelse. 

Kontaktuppgifter för anställningen

Har du frågor om anställningen är du välkommen att kontakta forskare Elias Eriksson, tfn: +46 709 555 055, e-post: mailto:Elias.Eriksson@neuro.gu.se

Ansvarig chef är professor/sektionschef Michael Winder, tfn: +46 31 786 34 77, e-post: mailto:michael.winder@pharm.gu.se

Ansökningshandlingar skickas inte till kontaktpersonerna.

Fackliga organisationer

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande

Ansökan

Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att registrera din ansökan elektroniskt via hemsidan: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar

Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Intyg om doktorsexamen bifogas med ansökan.

Ansökan ska vara inkommen senast: 2026-07-29

Vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi vid Sahlgrenska akademin bedrivs omfattande forskning och undervisning över stora kunskapsområden - från molekyl till människa. Verksamheten utgörs av fem sektioner; farmakologi, fysiologi, hälsa och rehabilitering, klinisk neurovetenskap samt psykiatri och neurokemi.

Institutionen för neurovetenskap och fysiologi söker nu en forskare med placering vid Sektionen för farmakologi.

Arbetsuppgifter

I anställningen ingår djurexperimentell forskning inom det psykofarmakologiska området, med tonvikt på beteendefarmakologiska studier.

Kvalifikationer

Doktorsavhandling inom preklinisk psykofarmakologi med inriktning på beteendestudier är ett krav. Erfarenhet av forskning om läkemedel mot depression och ångest med användning av relevanta djurmodeller är meriterande. Erfarenhet av in vivo-mikrodialys är också meriterande.

Vi lägger stor vikt vid personlig lämplighet.

Anställning

Anställningen är en tidsbegränsad anställning i 6 månader, 100% av heltid, med placering tills vidare vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi. Tillträde: snarast eller enligt överenskommelse. 

Kontaktuppgifter för anställningen

Har du frågor om anställningen är du välkommen att kontakta forskare Elias Eriksson, tfn: +46 709 555 055, e-post: mailto:Elias.Eriksson@neuro.gu.se

Ansvarig chef är professor/sektionschef Michael Winder, tfn: +46 31 786 34 77, e-post: mailto:michael.winder@pharm.gu.se

Ansökningshandlingar skickas inte till kontaktpersonerna.

Fackliga organisationer

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande

Ansökan

Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att registrera din ansökan elektroniskt via hemsidan: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar

Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Intyg om doktorsexamen bifogas med ansökan.

Ansökan ska vara inkommen senast: 2026-07-29

Vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi vid Sahlgrenska akademin bedrivs omfattande forskning och undervisning över stora kunskapsområden - från molekyl till människa. Verksamheten utgörs av fem sektioner; farmakologi, fysiologi, hälsa och rehabilitering, klinisk neurovetenskap samt psykiatri och neurokemi.

Institutionen för neurovetenskap och fysiologi söker nu en forskare med placering vid Sektionen för farmakologi.

Arbetsuppgifter

I anställningen ingår djurexperimentell forskning inom det psykofarmakologiska området, med tonvikt på beteendefarmakologiska studier.

Kvalifikationer

Doktorsavhandling inom preklinisk psykofarmakologi med inriktning på beteendestudier är ett krav. Erfarenhet av forskning om läkemedel mot depression och ångest med användning av relevanta djurmodeller är meriterande. Erfarenhet av in vivo-mikrodialys är också meriterande.

Vi lägger stor vikt vid personlig lämplighet.

Anställning

Anställningen är en tidsbegränsad anställning i 6 månader, 100% av heltid, med placering tills vidare vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi. Tillträde: snarast eller enligt överenskommelse. 

Kontaktuppgifter för anställningen

Har du frågor om anställningen är du välkommen att kontakta forskare Elias Eriksson, tfn: +46 709 555 055, e-post: mailto:Elias.Eriksson@neuro.gu.se

Ansvarig chef är professor/sektionschef Michael Winder, tfn: +46 31 786 34 77, e-post: mailto:michael.winder@pharm.gu.se

Ansökningshandlingar skickas inte till kontaktpersonerna.

Fackliga organisationer

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande

Ansökan

Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att registrera din ansökan elektroniskt via hemsidan: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar

Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Intyg om doktorsexamen bifogas med ansökan.

Ansökan ska vara inkommen senast: 2026-07-29

Forskningsingenjör vid Grimsö forskningsstation

Vi söker en självständig och noggrann person till DNA-laboratoriet på Grimsö forskningsstation. Vi riktar oss till dig som är intresserad av förvaltingen och forskningen av stora rovdjur. Med hjälp av DNA-metoder förser vi olika myndigheter med faktabaserad information som verkar för en hållbar förvaltning av rovdjur i Sverige samt genom forskning öka förståelsen om rovdjurens ekologi. 

Om jobbet

Du kommer att jobba i ett team som analyserar DNA-prov från rovdjur. Det huvudsakliga projektet bygger på att bitså förvaltande myndigheter med DNA-analyser som syftar att inventera och förvalta vargpopulationen i Sverige. Utöver detta bedrivs DNA-analyser på flera andra arter och forskningsprojekt, vilka kan behöva ditt deltagande. 

Arbetsuppgifterna omfattar:

• laborativt och analytiskt arbete, med DNA-extraktion av biologiskt material från djur
• genetisk profilering (genotypbestämning) och hantering av SNP-data för att bland annat identifiera individer och deras släktskap till andra individer i olika populationer
• medverkan i rapportering och framtagning av informationsmaterial
• medverkan i forskningsprojekt och utvecklingen av nya metoder/processer i och utanför DNA-labbet.

Allt arbete kommer ske på Grimsö forskningsstation.

Din bakgrund 

• Akademisk utbildning i biologi, motsvarande minst MSc med flera kurser i genetik och/eller molekylär ekologi. 
• God erfarenhet av att extrahera och analysera DNA-prover och molekylära data.
• Avancerad kunskap av ordbehandlingsprogram, inkluderat Microsoft Word, analysprogram, inkluderat Microsoft Excel och R för programmering. 
• Kunskaper om next-generation sequencing och användandet python- och bash-skript är meriterande.
• B-körkort och tillgång till egen bil.

Det är en förutsättning att du har ett metodiskt arbetssätt, ett kritiskt tänkande, är noggrann och har analytisk förmåga. Andra angelägna personliga egenskaper för arbetet är god samarbetsförmåga, ett flexibelt och självgående arbetssätt samt förmåga att hantera flera parallella arbetsuppgifter samtidigt.

Om oss

Grimsö forskningsstation utgör en unik arbetsmiljö för att studera vilda djur och fåglar. Utöver de ca 40 personer som jobbar på stationen är vi en samlingspunkt som attraherar besökande forskare, myndighetspersoner och studenter. Vi befinner oss i ett forskningsområde på 13 000 hektar som vi använder för forskning och utbildning. Här finns en bred kompetens för att studera vilda djurs ekologi, levnadssätt, livshistoria, utbredning och genetiska variation. Vi bedriver forskning som tillämpas i förvaltningen av stora djur och fåglar i Sverige. Vi har ett stort nätverk av forskare och representanter för myndigheter och civilsamhällesorganisationer. Genom publicering och samarbeten har vi en global spridning av vår unika kunskap om djurs förvaltning och bevarande.  

Mer information om institutionen/avdelningen:https://www.slu.se/om-slu/organisation/institutioner/ekologi/grimso-forskningsstation/om-grimso-forskningsstation/

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering:

Grimsö forskningsstation.

Anställningsform:

Tidsbegränsad anställning 12 månader.

Omfattning:

100%.

Tillträde:

Enligt överenskommelse.

Ansökan:

Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2026-07-31.

Fackliga kontaktpersoner:

https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

Doktorand i växtbiologi inom funktionell genomik i barrträd

Institutionen för fysiologisk botanik

Institutionen för fysiologisk botanik vid Umeå universitet utlyser en doktorandanställning inom projektet Con-TEki, som undersöker rollen hos transposabla element (TEs) som drivkrafter för regulatorisk innovation i barrträd (gran och tall).

Institutionen är en del av Umeå Plant Science Centre (UPSC; www.upsc.se), en internationellt ledande forskningsmiljö med cirka 200 forskare inom växtbiologi, inklusive molekylärbiologi, genomik, fysiologi och bioinformatik. UPSC erbjuder tillgång till avancerad infrastruktur för växttransformation, sekvensering, beräkningsanalys och avancerad mikroskopi i en starkt samarbetsinriktad och tvärvetenskaplig miljö.

Projektbeskrivning

Barrträdsgenom är mycket stora och rika på transposabla element, men de funktionella konsekvenserna av TE-integrationer för genreglering är fortfarande dåligt förstådda. Con-TEki-projektet syftar till att förstå hur TE-härledda regulatoriska element bidrar till divergens i genuttryck och adaptiva responser i barrträd.

Detta doktorandprojekt fokuserar på utveckling och implementering av metoder för funktionell validering av regulatoriska element i barrträdssystem. Arbetet kommer att integrera storskaliga regulatoriska genomikdata med experimentell molekylärbiologi för att direkt testa hypoteser genererade från genomdata.

Projektet omfattar integration av genomdata (t.ex. kromatintillgänglighet, genuttryck och metyleringsdata) med experimentella metoder för att validera kandidatregulatoriska element och genregulatoriska mekanismer. Särskild vikt kommer att läggas vid att etablera robusta och reproducerbara arbetsflöden för funktionella analyser i gran och tall.

Inom ramen för projektet ges goda möjligheter att utveckla kompetens i gränslandet mellan experimentell molekylärbiologi och bioinformatik. Projektet kommer att använda transformations- och valideringsplattformar vid UPSC, vilket möjliggör direkt testning av kandidatregulatoriska element i barrträdssystem. Projektet är särskilt väl lämpat för kandidater med ett starkt intresse för utveckling och optimering av experimentella metoder. Erfarenhet av reportergenanalyser, transienta expressionssystem eller genomredigering är särskilt meriterande.

Arbetsuppgifter

Doktoranden kommer att utbildas i att:

• Utveckla och implementera experimentella metoder för funktionell validering av regulatoriska element
• Utföra molekylärbiologiska experiment, inklusive nukleinsyraextraktion och bibliotekspreparering för sekvensering
• Bidra till generering, bearbetning och tolkning av genomdata
• Integrera experimentella resultat med beräkningsbaserade analyser
• Utveckla reproducerbara arbetsflöden för experimentella och analytiska moment
• Delta i vetenskaplig kommunikation genom presentationer och publikationer

Behörighet 

Grundläggande behörighet har den som har avlagt en examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper. Fakultetsnämnden får för en enskild sökande medge undantag från kravet på grundläggande behörighet om det finns särskilda skäl. (HF 7 kap 39 §)  

För att uppfylla kravet på särskild behörighet att antas till utbildning på forskarnivå i växtbiologi krävs att den sökande fullgjort kursfordringar om minst 90 högskolepoäng på avancerad nivå i biologi, eller andra ämnen med relevans för forskningsområdet, t ex, kemi, fysik eller datavetenskap. Av dessa måste minst 15 högskolepoäng vara från kurser med direkt relevans för forskningsprojektet, och minst 15 högskolepoäng från ett individuellt projektarbete.  Goda kunskaper i engelska, båda skriftliga och muntliga, är också ett krav.  

Kraven på förkunskaper enligt ovan anses uppfyllda även av den som i annan ordning förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper. 

Kvalifikationer

Krav

• Praktisk erfarenhet av molekylärbiologiska metoder
• God förmåga att arbeta experimentellt på ett strukturerat och reproducerbart sätt
• God förmåga att kommunicera på engelska i tal och skrift

Meriterande

• Erfarenhet av högkapacitetssekvensering (t.ex. RNA-seq, ATAC-seq eller liknande)
• Erfarenhet av arbete med växtmaterial
• Erfarenhet av bioinformatik, programmering eller dataanalys
• Erfarenhet av metodutveckling och optimering

Om anställningen

Anställningen syftar till en doktorsexamen och doktorandens huvuduppgift är att ägna sig åt sin forskarutbildning vilket innefattar såväl deltagande i ovan beskrivna forskningsprojekt som i forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan undervisning och annat institutionsarbete (maximalt 20%) ingå. Anställningen är tidsbegränsad till fyra år heltid eller upp till fem år vid undervisning deltid. Löneplaceringen sker enligt fastställd lönestege för doktorandanställning. 

Tillträde den 5 oktober 2026 eller enligt överenskommelse.

Ansökan

Ansökan ska vara skriven på engelska (företrädesvis) eller svenska och lämnas via Umeå universitets rekryteringssystem Varbi. Sista ansökningsdag är 31 juli, 2026.

En fullständig ansökan ska innehålla:

• Personligt brev (max 2 sidor) där du beskriver dina kvalifikationer och vad som motiverar dig till att söka anställningen
• CV
• Kopior av examensbevis och dokumentation av fullföljda högskolekurser och betyg
• Kontaktuppgifter till 2–3 referenser
• Eventuella övriga handlingar som den sökande vill åberopa

Kontakt

Vid frågor, kontakta: Professor Nathaniel R. Street, Umeå universitet, nathaniel.street@umu.se